psRNATarget 与 TargetFinder 两算法结果的交集合并器。
高置信靶标定义为:同一 (miRNA, 靶标 mRNA, 靶位点) 同时被两种算法命中。 由于两算法报告的坐标可能存在小幅偏移,采用 ±Intersection.SiteTolerance nt 的容差进行对齐。
psRNATarget 与 TargetFinder 两算法结果的交集合并器。
高置信靶标定义为:同一 (miRNA, 靶标 mRNA, 靶位点) 同时被两种算法命中。 由于两算法报告的坐标可能存在小幅偏移,采用 ±Intersection.SiteTolerance nt 的容差进行对齐。
01 Syntax
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Merge | 1 | 取两算法命中集合的交集。 |
| IsSameSite | 1 | 判断两命中是否属于同一靶位点: miRNA 与 靶标 mRNA 标识一致,且 mRNA 靶位点区间在容差内重叠。 |
| NormalizeTarget | 1 | 去除 secondary 后缀后用于比较的靶标标识。 |
| MergeHit | 1 | 合并两个同源命中:保留坐标,互补注释期望值、错配/G:U/gap 计数, 标记是否任一算法判为翻译抑制候选。 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| SiteTolerance | 1 | mRNA 靶位点坐标对齐容差(nt),默认 ±3。 |
04 Members
IEnumerable(Of siRNAHit), IEnumerable(Of siRNAHit))取两算法命中集合的交集。
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
psrna | IEnumerable(Of siRNAHit) | psRNATarget 命中结果 |
targetFinder | IEnumerable(Of siRNAHit) | TargetFinder 命中结果 |
判断两命中是否属于同一靶位点: miRNA 与 靶标 mRNA 标识一致,且 mRNA 靶位点区间在容差内重叠。
String)去除 secondary 后缀后用于比较的靶标标识。
合并两个同源命中:保留坐标,互补注释期望值、错配/G:U/gap 计数, 标记是否任一算法判为翻译抑制候选。
mRNA 靶位点坐标对齐容差(nt),默认 ±3。