为了加快计算速度而生成的窗口计算缓存,请注意,在生成缓存的时候已经进行了并行化,所以在内部生成缓存的时候,不需要再进行并行化了
NucleicAcid
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.DNA_Comparative.DeltaSimilarity1998.NucleicAcid
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GetValue | 1 | Get value by using a paired of base. |
| .ctor | 2 | Fasta序列会自动使用FastaSeq.Title来作为序列的NucleicAcid.UserTag |
| CreateFragments | 1 | Create slide windows on the given sequence data |
03 Properties
04 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| DNA_segments | 1 | 为了防止反复重新创建划窗而构建出来的计算数据缓存 |
05 Members
GetValue(
DNA, DNA)Get value by using a paired of base.
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
X | DNA | - |
Y | DNA | - |
#ctor(
DNA())窗口数据或者缓存数据
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
nt | DNA() | - |
#ctor(
FastaSeq)Fasta序列会自动使用FastaSeq.Title来作为序列的NucleicAcid.UserTag
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
nt | FastaSeq | - |
CreateFragments(
Int32, Int32)Create slide windows on the given sequence data
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
winSize% | Int32 | - |
step% | Int32 | - |
length
the size of current nt sequence.
DNA_segments
为了防止反复重新创建划窗而构建出来的计算数据缓存
UserTag