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Mirror 或者 Palindrome 位点的搜索结果的csv文件存储模型
PalindromeLoci
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceTools.SequencePatterns.Topologically.PalindromeLoci
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| SelectMaxLengthSite | 1 | 选出最长的片段 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Loci | 1 | 特殊的位点序列 |
| Start | 1 | Location.left |
| Palindrome | 1 | 回文序列，在生成Mirror镜像位点数据的时候是使用这个和PalindromeLoci.Loci组合产生的 |
| PalEnd | 1 | Location.right |
| MirrorSite | 1 | 和PalindromeLoci.Loci相对应的反向序列 |
| SequenceData | 1 | sequence data for loci value Contig.MappingLocation). |
04 Members
SelectMaxLengthSite(
IEnumerable(Of PalindromeLoci))选出最长的片段
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
sites | IEnumerable(Of PalindromeLoci) | - |
Loci
特殊的位点序列
Start
Location.left
Palindrome
回文序列，在生成Mirror镜像位点数据的时候是使用这个和PalindromeLoci.Loci组合产生的
PalEnd
Location.right
MirrorSite
和PalindromeLoci.Loci相对应的反向序列
SequenceData
sequence data for loci value Contig.MappingLocation. (理论上这个序列属性的值应该是等于PalindromeLoci.Loci + PalindromeLoci.MirrorSite)