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基于经验交换率矩阵（Dayhoff / JTT / WAG / LG）的氨基酸替换模型。
EmpiricalAminoAcidModel
00 Remarks
速率矩阵按 Q_ij = S_ij * π_j（i≠j）、Q_ii = -Σ_{j≠i} Q_ij 构建， 并归一化使得每位点的期望替换速率为 1，即以“每个位点一次替换”为时间单位。
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.Visualize.Phylip.Evolution.MaximumLikelihood.EmpiricalAminoAcidModel
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| TransitionProbability | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Exchangeability | 1 | 对称的交换率矩阵 S（已归一化） |
| RateMatrix | 1 | 瞬时速率矩阵 Q（行和为 0） |
| Pi | 1 | |
| Model | 1 |
04 Members
Exchangeability
对称的交换率矩阵 S（已归一化）
RateMatrix
瞬时速率矩阵 Q（行和为 0）
Pi
Model
TransitionProbability(
Double)