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由比对位点矩阵估计两两之间的进化距离，是距离法（UPGMA / NJ 以及 ML 初始树）的前置步骤。
SequenceDistance
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.Visualize.Phylip.Evolution.Distance.SequenceDistance
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| PairwiseMatrix | 1 | 计算整个字符矩阵的两两距离方阵。 |
| PairwiseDistance | 1 | 计算两条（已编码的）序列之间的距离。 |
| Correction | 1 | 将观测到的差异比例 p 依据给定的替换模型转换为进化距离。 |
03 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| MinDistance | 2 | 当两条序列完全相同时所使用的最小距离，避免后续出现除零。 |
04 Members
PairwiseMatrix(CharacterMatrix, DistanceModel)
计算整个字符矩阵的两两距离方阵。
计算两条（已编码的）序列之间的距离。
将观测到的差异比例 p 依据给定的替换模型转换为进化距离。
MinDistance
当两条序列完全相同时所使用的最小距离，避免后续出现除零。
MinDistance