替换模型抽象:描述氨基酸(或其他字符状态)随时间发生替换的概率过程。
SubstitutionModel
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Interops.Visualize.Phylip.Evolution.MaximumLikelihood.SubstitutionModel
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| TransitionProbability | 1 | 计算在时间 t 内从状态 i 变为状态 j 的转移概率矩阵 P(t) = e^{Qt}。 |
| Load | 1 | 依据给定的氨基酸替换模型名称加载模型实例。 |
03 Properties
04 Members
TransitionProbability(
Double)计算在时间 t 内从状态 i 变为状态 j 的转移概率矩阵 P(t) = e^{Qt}。
Load(AminoAcidModel)
依据给定的氨基酸替换模型名称加载模型实例。
Pi
平衡频率向量 π
Dimension
状态空间的大小