FastPass

Full name SMRUCC.genomics.Model.MotifGraph.ProteinStructure.Linclust.FastPass Assembly SMRUCC.genomics.Model.MotifGraph.ProteinStructure Members 10

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01 Syntax

SMRUCC.genomics.Model.MotifGraph.ProteinStructure.Linclust.FastPass

02 Fields

Name	Overloads	Summary
Pass	2	是否通过阶段三预筛选
MatchLength	2	锚点向两端延伸得到的最佳无缺口匹配长度
Identical	2	该匹配区内的一致字符数(含匹配)
QueryStart	2	匹配区在成员序列上的起点
SubjectStart	2	匹配区在中心序列上的起点

03 Members

field Pass #

Pass

是否通过阶段三预筛选

field MatchLength #

MatchLength

锚点向两端延伸得到的最佳无缺口匹配长度

field Identical #

Identical

该匹配区内的一致字符数(含匹配)

field QueryStart #

QueryStart

匹配区在成员序列上的起点

field SubjectStart #

SubjectStart

匹配区在中心序列上的起点

field Pass overload 2 #

Pass

field MatchLength overload 2 #

MatchLength

field Identical overload 2 #

Identical

field QueryStart overload 2 #

QueryStart

field SubjectStart overload 2 #

SubjectStart