基因信息结构,存储单个基因的坐标、方向及功能注释等信息
GeneInfo
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Model.OperonMapper.ContextModel.GeneInfo
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GeneID | 1 | 基因的唯一标识符 |
| Start | 1 | 基因在基因组上的起始位置 |
| End | 1 | 基因在基因组上的终止位置 |
| Length | 1 | 基因的长度 (bp) |
| Strand | 1 | 基因所在的链方向 ('+' 或 '-') |
| GO_Terms | 1 | 基因关联的 Gene Ontology 术语列表 |
| EC_numbers | 1 | 基因关联的EC编号列表,用于KEGG代谢网络分析 |
| PhylogeneticProfile | 1 | 基因的系统发育谱,键为参考基因组ID,值为该基因是否在该基因组中存在 |
03 Members
GeneID
基因的唯一标识符
Start
基因在基因组上的起始位置
End
基因在基因组上的终止位置
Length
基因的长度 (bp)
Strand
基因所在的链方向 ('+' 或 '-')
GO_Terms
基因关联的 Gene Ontology 术语列表
EC_numbers
基因关联的EC编号列表,用于KEGG代谢网络分析
PhylogeneticProfile
基因的系统发育谱,键为参考基因组ID,值为该基因是否在该基因组中存在
Remarks
基因组ID -> 存在状态