参考基因组信息结构,用于计算邻域保守性和系统发育距离
GenomeInfo
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Model.OperonMapper.ContextModel.GenomeInfo
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| ToString | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| GenomeID | 1 | 参考基因组的唯一标识符 |
| Phylum | 1 | 参考基因组所属的门 用于计算基因在该门中的存在概率 pik |
| GeneCount | 1 | 参考基因组中的基因总数 Nk |
| GenePositions | 1 | 基因在基因组中的位置索引字典,键为基因ID,值为位置索引 用于计算邻域保守性中的 dk(ij) (两基因间的基因数量) |
04 Members
GenomeID
参考基因组的唯一标识符
Phylum
参考基因组所属的门 用于计算基因在该门中的存在概率 pik
GeneCount
参考基因组中的基因总数 Nk
GenePositions
基因在基因组中的位置索引字典,键为基因ID,值为位置索引 用于计算邻域保守性中的 dk(ij) (两基因间的基因数量)
Remarks
基因ID -> 位置索引
ToString()