OperonHmmer

Full name SMRUCC.genomics.Model.OperonMapper.OperonHmmer Assembly SMRUCC.genomics.Model.OperonMapper Members 2

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Model.OperonMapper.OperonHmmer

02 Methods

Name	Overloads	Summary
DiscretizeAllFeatures	1	将 FeatureScores 中的所有特征离散化为单一的观测符号 (全特征版) 注意：此方法会产生大量组合符号，可能导致HMM状态空间爆炸
DiscretizeFeaturesReduced	1	将 FeatureScores 降维离散化 (推荐用于HMM) 将特征分为物理、进化、功能三组，组内综合打分后再离散化

03 Members

method DiscretizeAllFeatures #

DiscretizeAllFeatures(FeatureScores)

将 FeatureScores 中的所有特征离散化为单一的观测符号 (全特征版) 注意：此方法会产生大量组合符号，可能导致HMM状态空间爆炸

Parameters

Name	Type	Description
`features`	FeatureScores	计算得到的特征得分对象

Returns

离散化后的观测符号字符串，例如 "S_C_S_E_0_N"

method DiscretizeFeaturesReduced #

DiscretizeFeaturesReduced(FeatureScores)

将 FeatureScores 降维离散化 (推荐用于HMM) 将特征分为物理、进化、功能三组，组内综合打分后再离散化

Parameters

Name	Type	Description
`features`	FeatureScores	计算得到的特征得分对象

Returns

离散化后的观测符号字符串，例如 "P1_E1_F1"