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单个 TSS 的 σ70 启动子打分结果。
PromoterScore
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.Regulation.PromoterScore
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| ToString | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Minus35Sequence | 1 | 35 区序列。 |
| Minus10Sequence | 1 | 10 区序列。 |
| Minus35Score | 1 | 35 区与共识序列 TTGACA 的匹配位数（0..6）。 |
| Minus10Score | 1 | 10 区与共识序列 TATAAT 的匹配位数（0..6）。 |
| TotalScore | 1 | 总分（0..12）。 |
| IsSigma70 | 1 | 是否为强候选 σ70 启动子（-35 与 -10 均至少匹配 4 位）。 |
| GeneID | 1 | |
| TSSs | 1 | |
| Strand | 1 |
04 Members
Minus35Sequence
-35 区序列。
Minus10Sequence
-10 区序列。
Minus35Score
-35 区与共识序列 TTGACA 的匹配位数（0..6）。
Minus10Score
-10 区与共识序列 TATAAT 的匹配位数（0..6）。
TotalScore
总分（0..12）。
IsSigma70
是否为强候选 σ70 启动子（-35 与 -10 均至少匹配 4 位）。
GeneID
TSSs
Strand
ToString()