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de novo 转录本集合。
DeNovoTranscripts
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.Assembly.DeNovoTranscripts
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Distinct | 1 | 去冗余：若一条转录本完全包含在另一条更长（且表达量不低太多）的转录本中，则丢弃它。 |
| ByExpression | 1 | 按表达量降序排列。 |
| Save | 1 | 输出 transcripts.txt（表头 + 数据行）。 |
| Load | 1 | 从 transcripts.txt 读取（跳过表头行）。 |
03 Members
Distinct(
Double)去冗余：若一条转录本完全包含在另一条更长（且表达量不低太多）的转录本中，则丢弃它。
Parameters
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
expressionTolerance | Double | 表达量容差比例（默认 0.2，即短转录本表达量不超过长转录本的 1.2 倍时视为冗余）。 |
ByExpression
按表达量降序排列。
Save(
String)输出 transcripts.txt（表头 + 数据行）。
Load(
String)从 transcripts.txt 读取（跳过表头行）。