BetaTest

Full name SMRUCC.genomics.Analysis.HTS.WGCNA.BetaTest Assembly SMRUCC.genomics.Analysis.HTS.WGCNA Members 11

test for best beta power value

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Analysis.HTS.WGCNA.BetaTest

02 Methods

Name	Overloads	Summary
BetaTable	1	利用一元线性回归取匹配最佳β值，即用不同的β值去试验，寻找最佳的β值在线性回归中，我们要求 R^2 大于0.8，slope位于 -1 左右，而平均连接度要尽可能大
Best	1	get the index of the max beta score from the candidates
ToString	1

03 Properties

04 Members

method BetaTable #

BetaTable(CorrelationMatrix, IEnumerable(Of Double), Double)

利用一元线性回归取匹配最佳β值，即用不同的β值去试验，寻找最佳的β值在线性回归中，我们要求 R^2 大于0.8，slope位于 -1 左右，而平均连接度要尽可能大

Parameters

Name	Type	Description
`cor`	`CorrelationMatrix`	-
`betaRange`	`IEnumerable(Of Double)`	-

Returns

函数返回得分最高的beta值

method Best #

get the index of the max beta score from the candidates

Parameters

Name	Type	Description
`beta`	BetaTest()	a set of the beta candidates on the correlation matrix

property Power #

Power

property sftRsq #

sftRsq

property slope #

slope

property truncatedRsq #

truncatedRsq

property meanK #

meanK

property medianK #

medianK

property maxK #

maxK

property score #

score

method ToString #

ToString()