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结构变异类型枚举
SVType
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.PanGenome.SVType
02 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| PAV_Absence | 2 | 缺失：该基因组相对于其他基因组缺少该基因家族 |
| PAV_Presence | 2 | 获得：该基因组相对于其他基因组特有该基因家族 |
| CNV_Gain | 2 | 拷贝数增加：相对于核心拷贝数增加 |
| CNV_Loss | 2 | 拷贝数减少：相对于核心拷贝数减少 |
| Collinearity_Break | 2 | 共线性断裂（倒位/易位） |
| None | 1 |
03 Members
PAV_Absence
缺失：该基因组相对于其他基因组缺少该基因家族
PAV_Presence
获得：该基因组相对于其他基因组特有该基因家族
CNV_Gain
拷贝数增加：相对于核心拷贝数增加
CNV_Loss
拷贝数减少：相对于核心拷贝数减少
Collinearity_Break
共线性断裂（倒位/易位）
None
PAV_Absence
PAV_Presence
CNV_Gain
CNV_Loss
Collinearity_Break