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一条被注释为转录起始位点（TSS）的结果记录。
TssSite
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.RNA_Seq.TSSAR.Models.TssSite
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Chromosome | 1 | 参考序列（染色体/contig）名称。 |
| Position | 1 | TSS 在基因组上面的 1-based 位置。 |
| Strand | 1 | TSS 所在的链方向。 |
| PValue | 1 | 多窗口几何平均之后的最终 p 值。 |
| PeakDifference | 1 | 归一化之后 [+] 与 [-] 文库的 read 起始计数差（peak difference）。 |
| PlusCoverage | 1 | [+] 文库在该位置的原始 read 起始计数。 |
| MinusCoverage | 1 | [-] 文库在该位置的原始 read 起始计数。 |
| Type | 1 | 基于基因注释的上下文分类。 |
| Gene | 1 | 关联基因的 locus_tag（若存在）。 |
| GeneLocation | 1 | 关联基因的位置字符串（若存在）。 |
| UtrLength | 1 | 当分类为 TssTypes.Primary 时，TSS 到关联基因起始密码子的距离（5'UTR 长度）。 非 Primary 时为 0。 |
| TexEfficiency | 1 | TEX 处理效率估计：[+] / ([+] + [-])，取值区间 [0, 1]。 该值越高说明该位点的初级转录本富集越明显。 |
| TssId | 1 | 该 TSS 在输出 BED 文件之中的编号（TSS_00001 格式）。 |
03 Members
Chromosome
参考序列（染色体/contig）名称。
Position
TSS 在基因组上面的 1-based 位置。
Strand
TSS 所在的链方向。
PValue
多窗口几何平均之后的最终 p 值。
PeakDifference
归一化之后 [+] 与 [-] 文库的 read 起始计数差（peak difference）。
PlusCoverage
[+] 文库在该位置的原始 read 起始计数。
MinusCoverage
[-] 文库在该位置的原始 read 起始计数。
Type
基于基因注释的上下文分类。
Gene
关联基因的 locus_tag（若存在）。
GeneLocation
关联基因的位置字符串（若存在）。
UtrLength
当分类为 TssTypes.Primary 时，TSS 到关联基因起始密码子的距离（5'UTR 长度）。 非 Primary 时为 0。
TexEfficiency
TEX 处理效率估计：[+] / ([+] + [-])，取值区间 [0, 1]。 该值越高说明该位点的初级转录本富集越明显。
TssId
该 TSS 在输出 BED 文件之中的编号（TSS_00001 格式）。