nuget
TSS 相对于基因组注释（PTT/GFF）的上下文分类， 对应 TSSAR 论文后处理阶段的 Primary / Internal / Antisense(Ai/Ad) / Orphan 分类。
TssTypes
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.RNA_Seq.TSSAR.Models.TssTypes
02 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Orphan | 2 | 孤儿 TSS：附近没有任何基因注释与之关联。 |
| Primary | 2 | 初级（Primary）TSS：位于某个基因起始密码子上游的启动子区（默认 250 nt 内）， 通常对应基因的 5'UTR 起点。 |
| Internal | 2 | 内部（Internal）TSS：位于某个基因的开放阅读框（ORF）内部，可能是内部启动子。 |
| AntisenseInternal | 2 | 反义内部（Antisense internal, Ai）：位于反义链基因的 ORF 内部。 |
| AntisenseDownstream | 2 | 反义下游（Antisense downstream, Ad）：位于反义链基因下游（默认 30 nt 内）。 |
03 Members
Orphan
孤儿 TSS：附近没有任何基因注释与之关联。
Primary
初级（Primary）TSS：位于某个基因起始密码子上游的启动子区（默认 250 nt 内）， 通常对应基因的 5'UTR 起点。
Internal
内部（Internal）TSS：位于某个基因的开放阅读框（ORF）内部，可能是内部启动子。
AntisenseInternal
反义内部（Antisense internal, Ai）：位于反义链基因的 ORF 内部。
AntisenseDownstream
反义下游（Antisense downstream, Ad）：位于反义链基因下游（默认 30 nt 内）。
Orphan
Primary
Internal
AntisenseInternal
AntisenseDownstream