psRNATarget 靶标可及性(UPE)评估接口,默认关闭(返回 0)。 如需基于 RNAup 计算解开能,可实现该接口后注入 psRNATarget。
IAccessibilityEvaluator
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment.siRNAHit.IAccessibilityEvaluator
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| UPE | 1 | 计算靶位点上游 17 nt / 下游 13 nt 侧翼区域的解开能(kcal/mol)。 UPE 越低,靶位点越易被小RNA结合。 |
03 Members
UPE(
String, Int32, Int32)计算靶位点上游 17 nt / 下游 13 nt 侧翼区域的解开能(kcal/mol)。 UPE 越低,靶位点越易被小RNA结合。