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API Docs / SMRUCC.genomics.Model.Metabolic.RouterAdapter / CompoundIndex

CompoundIndex

Full name SMRUCC.genomics.Model.Metabolic.RouterAdapter.Data.CompoundIndex Assembly SMRUCC.genomics.Model.Metabolic.RouterAdapter Members 2

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Model.Metabolic.RouterAdapter.Data.CompoundIndex

02 Methods

NameOverloadsSummary
Build 1 批量构建结构索引。单条脏数据只跳过并计数,绝不让装配整体失败。
DegreeOf 1 反应"参与度"统计:各化合物在反应中作为底物/产物出现的总次数, 用于识别枢纽代谢物(Core 模式下汇集合的判定依据之一)。

03 Members

method Build #
Build(IEnumerable(Of CompoundSeed), Int32)

批量构建结构索引。单条脏数据只跳过并计数,绝不让装配整体失败。

Parameters
NameTypeDescription
seedsIEnumerable(Of CompoundSeed)

化合物种子序列(可为任意数据源的产物)。

maxAtomsInt32

单个分子的重原子数上限;超出者跳过(控耗时)。

Returns

结构索引与诊断统计。

method DegreeOf #
DegreeOf(IEnumerable(Of ReactionSpec))

反应"参与度"统计:各化合物在反应中作为底物/产物出现的总次数, 用于识别枢纽代谢物(Core 模式下汇集合的判定依据之一)。

Parameters
NameTypeDescription
specsIEnumerable(Of ReactionSpec)

已归正的反应契约集合。

Returns

compound id → 出现次数。