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SMRUCC.genomics.Model.Metabolic.RouterAdapter 1.0.9753.40023.
01 Namespaces
SMRUCC.genomics.Model.Metabolic.RouterAdapter
| Type | Summary | Members |
|---|---|---|
| AtomMapping | 1 | |
| BioCycAdapter | 把 BioCyc（MetaCyc/EcoCyc）PGDB 装配成 RetroPath 的逆向合成通路搜索器。 构造期一次性完成： 1) 化合物结构索引（SMILES 净化 + 元素白名单 + 解析）； 2) 反应实例 → 广义反应规则（MCS 原子映射 + 反应中心提取 + SMARTS 泛化）； 3) 底盘内源代谢物汇集合。 之后每… | 16 |
| BioCycRuleMiner | 3 | |
| BioCycSink | 2 | |
| IRouter | 代谢网络通路搜索器的统一契约：目标导向的逆向搜索 + 起点导向的定向合成搜索。 | 2 |
| MappingResult | 一次反应两侧（反应物集合 ↔ 产物集合）的原子映射结果 | 5 |
| McsSearch | 键级保守的诱导式最大公共子图搜索（贪心下界 + 带预算回溯） | 5 |
| MetabolicAdapter | 把 GCModeller 内部标准代谢网络（化合物 + 反应的集合）装配成 RetroPath 的 逆向合成通路搜索器。 | 15 |
| MetabolicRuleMiner | 3 | |
| MetabolicSink | 2 |
SMRUCC.genomics.Model.Metabolic.RouterAdapter.Data
| Type | Summary | Members |
|---|---|---|
| CompoundIndex | 2 | |
| CompoundIndexResult | 结构索引的构建结果。 | 7 |
| CompoundSeed | 结构索引的输入种子：一个待索引的化合物。 | 5 |
| CompoundStructure | 一个可被 RetroPath 使用的化合物结构（净化后的 SMILES + 分子图 + 可选名称信息）。 | 5 |
| ReactionSpec | 与数据源无关的反应契约——规则挖掘引擎（RuleMiner）的唯一输入。 | 10 |
| RuleMiner | 13 | |
| SinkBuilder | 3 | |
| SinkModes | 4 | |
| SmilesSanitizer | 8 |
SMRUCC.genomics.Model.Metabolic.RouterAdapter.Data.RuleMiner
| Type | Summary | Members |
|---|---|---|
| PatternEdge | 类图上的一条边：两侧键级（0 = 该侧不存在此键） | 2 |