单个复制子(染色体/质粒)的核酸序列模型。
Replicon
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.Core.Replicon
02 Methods
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Name | 1 | 复制子名称(FASTA 头行)。 |
| SequenceData | 1 | 规范化后的 DNA 序列(大写、U→T、歧义字符→'^')。 |
| Length | 1 | 序列长度。 |
04 Members
#ctor(
String, String)使用给定名称与序列构造 Replicon(序列会被规范化)。
Load(
String)从 FASTA 文件读取单个复制子。
FromFasta(
FastaSeq)从 FASTA 对象构造。
normalize(
String)序列规范化:大写化、U→T、歧义字符替换为 '^'。
Name
复制子名称(FASTA 头行)。
SequenceData
规范化后的 DNA 序列(大写、U→T、歧义字符→'^')。
Length
序列长度。