nuget
一次比对命中。
AlignmentHit
01 Syntax
SMRUCC.genomics.SequenceModel.RNA_Seq.Rockhopper.Alignment.AlignmentHit
02 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| RepliconIndex | 1 | 复制子下标。 |
| Position | 1 | 1-based 最左位置。 |
| IsReverse | 1 | 是否比对到负链。 |
| ReadID | 1 | 读段标识。 |
| Sequence | 1 | 读段序列（原始正向）。 |
| Quality | 1 | 质量字符串。 |
| Cigar | 1 | 简化 CIGAR。 |
| Mismatches | 1 | 错配数。 |
| PairedEndIndex | 1 | 双端 mate 下标（-1 表示单端）。 |
03 Members
RepliconIndex
复制子下标。
Position
1-based 最左位置。
IsReverse
是否比对到负链。
ReadID
读段标识。
Sequence
读段序列（原始正向）。
Quality
质量字符串。
Cigar
简化 CIGAR。
Mismatches
错配数。
PairedEndIndex
双端 mate 下标（-1 表示单端）。