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单个聚类簇
Cluster
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Model.MotifGraph.ProteinStructure.Linclust.Cluster
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| ToString | 1 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| representative | 1 | 代表序列 ID(簇中最长成员) |
| members | 1 | 簇内全部成员序列 ID(含代表) |
| memberScores | 1 | 成员序列 ID -> 相对代表序列的 Smith-Waterman 比对 score。 代表序列自身记为该簇内成员比对 score 的最大值(语义上代表其家族内最优同源强度)。 该字典由阶段五 GreedyCover.Cluster()) 依据携带 score 的有向边填充, 供结果导出模块(ClusterExporter)读取,作为 Sequence… |
04 Members
representative
代表序列 ID(簇中最长成员)
members
簇内全部成员序列 ID(含代表)
memberScores
成员序列 ID -> 相对代表序列的 Smith-Waterman 比对 score。 代表序列自身记为该簇内成员比对 score 的最大值(语义上代表其家族内最优同源强度)。 该字典由阶段五 GreedyCover.Cluster() 依据携带 score 的有向边填充, 供结果导出模块(ClusterExporter)读取,作为 SequenceCluster.score 的数据来源。 旧调用方(如仅读取 representative/members)可忽略此字段。
ToString()