起始密码子评分模型 统计不同起始密码子(ATG/GTG/TTG)的使用频率, 计算起始密码子类型得分(tscore)
StartCodonModel
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Annotation.Prodigal.StartCodonModel
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| BuildModel | 1 | 从训练基因构建起始密码子频率模型 |
| ComputeTypeScore | 1 | 计算起始密码子类型得分(tscore) ATG通常最常见,得分最高;GTG次之;TTG最低 |
03 Members
BuildModel(TrainingModel,
List(Of CandidateORF))从训练基因构建起始密码子频率模型
ComputeTypeScore(CandidateORF, TrainingModel)
计算起始密码子类型得分(tscore) ATG通常最常见,得分最高;GTG次之;TTG最低