DIAMOND 灵敏度模式。本质是在种子数量与过滤严格度之间滑动。
SensitivityMode
01 Syntax
SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment.DIAMOND.SensitivityMode
02 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Fast | 2 | 默认模式:2 个权重 10 的形状,约 8000 倍于 BLASTP 加速。 |
| Sensitive | 2 | 16 个权重 8 形状。 |
| VerySensitive | 2 | 14 个权重 7 形状,接近 BLASTP 灵敏度。 |
| UltraSensitive | 2 | 64 个权重 7 形状,灵敏度与 BLASTP 持平。 |
03 Members
Fast
默认模式:2 个权重 10 的形状,约 8000 倍于 BLASTP 加速。
Sensitive
16 个权重 8 形状。
VerySensitive
14 个权重 7 形状,接近 BLASTP 灵敏度。
UltraSensitive
64 个权重 7 形状,灵敏度与 BLASTP 持平。
Fast
Sensitive
VerySensitive
UltraSensitive