LeftMostSeedFilter

Full name SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment.DIAMOND.LeftMostSeedFilter Assembly SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment Members 2

最左种子去冗余过滤器。跨形状累积已见过的种子命中,丢弃左侧已覆盖的冗余命中。

01 Syntax

SMRUCC.genomics.Analysis.SequenceAlignment.DIAMOND.LeftMostSeedFilter

02 Methods

Name	Overloads	Summary
Keep	1	判定一个种子命中是否应保留(非冗余)。若该 subject 上已存在一条查询坐标更靠左、且在容差范围内的命中,则丢弃。
Reset	1	清空跨形状累积状态(每条查询处理开始时调用)。

03 Members

method Keep #

Keep(Int32, Int32, Int32)

判定一个种子命中是否应保留(非冗余)。若该 subject 上已存在一条查询坐标更靠左、且在容差范围内的命中,则丢弃。

Parameters

method Reset #

Reset

清空跨形状累积状态(每条查询处理开始时调用)。