多结构域融合酶检测。
如果一个蛋白同时携带多个 EC 编号,并且这些 EC 所对应的反应在同一条通路中构成 连续(间隔不超过 GPRParameters.MaxGapInPathway 步)的酶促步骤, 则认为这是一个融合酶,并对其在通路中真正参与的反应给出证据。
多结构域融合酶检测。
如果一个蛋白同时携带多个 EC 编号,并且这些 EC 所对应的反应在同一条通路中构成 连续(间隔不超过 GPRParameters.MaxGapInPathway 步)的酶促步骤, 则认为这是一个融合酶,并对其在通路中真正参与的反应给出证据。
01 Syntax
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| CollectEvidence | 1 | 收集某个基因的融合酶证据 |
| EvaluateContinuity | 1 | 计算若干反应在同一条通路内部的连续程度,取值 [0, 1]。 通过有界广度优先搜索统计"存在有向相邻关系"的反应对比例, 从而把同一通路内彼此无关的反应排除出去。 |
03 Members
GeneTable, GPRParameters)收集某个基因的融合酶证据
计算若干反应在同一条通路内部的连续程度,取值 [0, 1]。
通过有界广度优先搜索统计"存在有向相邻关系"的反应对比例, 从而把同一通路内彼此无关的反应排除出去。