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反应连续性检查。
对于基因当前"已经支持"的反应集合，统计其中存在的"产物即下游底物"关系， 并据此对相关反应给出增益证据。
注意：本类只对基因已经支持的反应给出增益，不会凭空创造新的关联， 因此它属于网络级的一致性证据，而不是猜测性证据。
ReactionContinuityChecker
01 Syntax
SMRUCC.genomics.GCModeller.CompilerServices.GPRLink.ReactionContinuityChecker
02 Methods
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| CollectEvidence | 1 | 收集连续性证据。 修复：原实现从未被任何调用方使用（死代码），且分数更新语句的语义混乱； 现在统一改造为"输入已支持反应集合、输出增益证据"的纯函数形式。 |
| LoadFromContext | 1 | 从参考网络上下文构建索引。 修复：改为索引 ContextIndices.ReactionIndex 中的"全部"反应， 原实现只索引带 EC 编号的反应，导致没有 EC 注释的反应永远无法参与连续性推断。 |
03 Properties
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| Size | 1 | 已经登记索引的反应数量 |
04 Fields
| Name | Overloads | Summary |
|---|---|---|
| reactionIndex | 1 | 反应编号 -> 反应对象 |
05 Members
收集连续性证据。
修复：原实现从未被任何调用方使用（死代码），且分数更新语句的语义混乱； 现在统一改造为"输入已支持反应集合、输出增益证据"的纯函数形式。
LoadFromContext(ContextIndices)
从参考网络上下文构建索引。
修复：改为索引 ContextIndices.ReactionIndex 中的"全部"反应， 原实现只索引带 EC 编号的反应，导致没有 EC 注释的反应永远无法参与连续性推断。
Size
已经登记索引的反应数量
reactionIndex
反应编号 -> 反应对象